Nel 1569 fu affidato al Vignola l’incarico di costruire la chiesa ma questa fu realizzata solo dopo la morte dell’architetto. L’edificio, ad una sola navata con tetto a capanna, divenne sede della Compagnia della SS.ma Trinità (o di S. Marco) nel 1607 (anno di istituzione della confraternita). Recentemente restaurata, la chiesa è stata riaperta nel 1973, conserva al suo interno diverse tele e affreschi di pregevole fattura. Attualmente si accede alla Chiesa tramite una larga e alta scalinata, che però in origine era più piccola dato che il livello del terreno era più alto, l’ingrandimento è dovuto ai recenti lavori di sistemazione di Piazza San Marco.